الكشف الجزيئي عن بعض الأسباب الطفيلية والبكتيرية للإسهال بين المرضى في محافظة بابل

الباحث

سرى محمد جاسم

المشرف

أحمد خضير الحميري - زينب هاشم الزبيدي

الجامعة

جامعة بابل

الكلية / القسم

كلية العلوم للبنات / علوم الحياة

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

انكليزي

الكلمات المفتاحية

Diarrhea ; Parasites ; Bacteria ; Molecular Detection

أجريت الدراسة الحالية خلال الفترة من أكتوبر 2021 إلى فبراير 2022 ٠ حيث اشتملت هذه الدراسة على فحص 100 عينة براز (أطفال ، بالغين ، ذكور وإناث) بطريقة الفحمص المجهري المباشر ، و 36 عينة إيجابية للطفيليات ، و 26 Ake إيجابية تم فحصها لبكتريا الاشريكية القولونية باستخدام تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) لمرضى الإسهال والمرضى المراجعين في مستشفى بابل للولادة والأطفال وكذلك بعض المراكز الصحية والمختبرات الخاصة في محافظة بابل وبعض نواحيها | وللفئات العمرية أقل من سنة إلى 21 سنة فأكثر. أظهرت الدراسة الحالية أن معدلات الإصابة بالطفيليات المسببة للإسهال (الاميبا الحالة للنسيج , الجيارديا ) بلغت 37/ موزعة كالتالي )235 و 2/ على التوالي) بطريقة المسحة المباشرة ومعدلات الإصابة بالإسهال المسببة للبكتيريا(الاشريكية القولونية ) كانت( 6 باستخدام الزرع على ماكونكي أجار وباستخدام تفاعل البوليمر المتسلسل (PCR) كانت معدلات الإصابة بالطفيليات ( 737.5 ) (الاميبا الحالة للنسيج , الجيارديا ) موزعة على النحو التالي (35.41/ ، 72.08 على التوالي) وكانت معدلات الإصابة ببكتيريا (الاشريكية القولونية) (26.04/). أظهرت نتائج الفحص المجهري لعينات الطفيليات المسببة للإسهال أن أعلى معدلات الإصابة كانت بين المناطق الريفية )743.1( مقارنة بالمدينة )730.6( وكانت أعلى معدلات الإصابة بين الذكور )738.4( مقابل GUY! (35.4/). وكانت أعلى معدلات الإصابة كانت )750( في الفئة العمرية (10-6) سنوات ، بينما كانت معدلات الإصابة منخفضة )10( في الفئة العمرية (21 سنة فأكثر). كما تبين أن أعلى معدلات الإصابة في وجود الحيوانات في منازل المصابين كانت (38.4/) ، مقابل عدم وجود حيوانات في تلك المنازل )736( أظهرت هذه الدراسة تبايناً في معدلات الإصابة حسب المستوى التعليمي لرب الأسرة ، ووجد أن أعلى معدلات الإصابة كانت لرب الأسرة الحاصل على تعليم ابتدائي ، حيث كانت نسبة الإصابة ( 750( بينما انخفضت معدلات الإصابة cal رب الأسرة الحاصل على تعليم أكاديمي (10/). أما بالنسبة للتوزيع الشهري للعدوى ، فقد سجلت الدراسة أن أعلى نسبة ا إصابة كانت في أكتوبر 2021 عندما كانت (45/) ، بينما كانت أقل نسبة إصابة (731.2) في فبراير )2022( في الدراسة الحالية ، تم استخدام تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) باستهداف الجين 18srRNA للاميبا الحالة للنسيج والجيارديا وجين 16srRNA لبكتريا الاشريكية القولونية ، والتي تم من خلالها فحص 96 عينة للفحص المجهري للطفيليات المسببة للإسهال (الاميبا الحالة للنسيج ¢ الجيارديا ) ، وبلغت معدلات الإصابة )737.5( ) وتوزعت على النحو التالي (35.41/ ، 22.08 ، على التوالي). أما بالنسبة للبكتيريا ، فقد تم فحص 96 عينة للبكتيريا المسببة للإسهال (الاشريكية القولونية) ، وبلغت معدلات الإصابة )126.04( بالاعتماد على تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل ، ظهرت أعلى معدلات الإصابة في المناطق الريفية للطفيليات والبكتيريا المسببة للإسهال ، حيث سجلت أعلى نسبة من الطفيليات (41.1/) ، Lay سجلت أعلى نسبة إصابة بكتيرية عند (28/). بينما انخفضت النسبة في الحضر للطفيليات والبكتيريا حيث سجلت أقل نسبة طفيليات )433.33( Leis سجلت أقل نسبة للبكتيريا (23.91/). اعتمادًا على تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل ، ظهر أعلى معدل إصابة عند الذكور )739.2( ، بينما انخفض معدل الإصابة عند GLY) )35,5( للطفيليات. أما بالنسبة للبكتيريا فقد سجلت الدراسة زيادة في معدل الإصابة عند SLY! )731.7( ، بينما انخفض معدل الإصابة بالعدوى عند الذكور (21.81/) ، وسجلت هذه الدراسة أعلى نسبة إصابة في الفئة العمرية (10-6) سنة وبلغت )750( بينما كان الانخفاض في معدل الإصابة في الفئة العمرية (21 سنة فأكثر) وكان (10/) للطفيليات . أما بالنسبة للبكتيريا فقد سجلت الدراسة أيضا زيادة في معدل الإصابة في الفئة العمرية )10-6( وصلت إلى (35.29/) بينما انخفضت الدراسة في الفئة العمرية (21 سنة فأكثر) حيث وصلت أيضا إلى )710( . أما بالنسبة للمعايير الأخرى للطفيليات فكانت أعلى معدلات الإصابة في وجود الحيوانات في المنازل )239.4( ، بينما انخفضت معدلات الإصابة بغياب الحيوانات في المنازل )736.2( ووجدت الدراسة أن أعلى معدلات الإصابة كانت لرب الأسرة الحاصل على تعليم ابتدائي )750( ، بينما انخفضت معدلات الإصابة مع رب الأسرة الحاصل على تعليم أكاديمي )710( وسجلت أعلى معدلات الإصابة في أكتوبر 2021 Lain , (745) سجلت الأشهر المتبقية معدلات متشابهة حيث سجلت (35.2/ ، 135.4، oats) (135.7 ، 135.6 2022 ، نوفمبر 2021 ، فبراير 2022 ، ديسمبر 2021 ، على التوالي) .أما بالنسبة لنوع الإصابة بالطفيليات والبكتيريا ، فقد كانت الإصابة المفردة أعلى نسبة في هذه المجموعة (81.13/) ، USE Cus طفيلي الأميبا الحالة للنسيج )460.46( ، وطفيلي الجيارديا ( 72.32 (، والبكتيريا( 737.2( للعدوى المفردة. أما الإصابة الكلية المزدوجة فقد بلغت ( 718.86( حيث شكل طفيلي الأميبا الحالة للنسيج مع الإشريكية القولونية (90/) بينما طفيلي الجيارديا مع الإشريكية القولونية (10/) . لم يتم تسجيل أي إصابة ثلاثية في هذه الدراسة. استنتج من خلال الدراسة الحالية أن انتشار الطفيليات المسببة للإسهال في محافظة بابل كان مرتفعا جدا من خلال الكشف بالطرق الميكروسكوبية والجزيئية (طريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل) وكانت المناطق الريفية بها معدلات إصابة أعلى من المناطق الحضرية.

The current study was conducted during the period from October 2021 to February 2022, this study included the examination of 100 stool samples microscopically by direct smear method (37%) samples positive for parasites and (26%) samples positive for Escherichia coli and then examined the positive results by using Polymerase Chain Reaction (PCR) technique. For peoples with diarrhea attending to Babylon Maternity and Children Hospital, as well as some health centers and private laboratories in Babylon province and some of its districts. The current study showed that the infection rates of diarrhea- causing parasites(Entamoeba histolytica , Giardia lamblia ) was (37%) , distributed as follows (35% and 2%, respectively) by direct smear methods , and the infection rates of diarrhea-causing by bacteria( Escherichia coli ) was (26%)by using cultured on the MacConky agar whereas by using polymear chain reaction (PCR) the infection rates for parasites (E.histolytica , G.lamblia ) were (37.5%) , distributed as follows ( 35.41%, 2.08% , respectively ), And the infection rates of E. coli was (26.04%) . The results of the microscopic examination of the samples for parasites causes diarrhea showed that the highest infection rates was among rural areas (43.1%) compared with urban area(30.6%). The highest infection rates in males(38.4%) compared to females (35.4%). The highest infection rates was (50%) with age group (6-10) years, while the lowest infection rates (10%) with age group (21 and over) years. The highest rates of infection with presence of animals in the houses of patients (38.4%), compared with absence of animals in those homes (36%) . This study showed a variation in the prevalence rates according to the level of education of the head of the family, the highest rates of infection for head of the family with a primary education (50%), while the infection rates decreased for the head of the family with academic education (10%). As for the monthly distribution of infection, the study recorded that the highest percentage of infection was in October 2021 (45%), while the lowest percentage of infection was (31.2%) in February 2022. In the current study, the polymerase chain reaction (PCR) technique was also used by targeting the gene 18srRNA for the E.histolytica , G.lamblia and gene 16srRNA for the E.coli, through 96 samples which were examined for microscopic examination of the parasites that cause diarrhea (E.histolytica,G.lamblia ), the infection rates were (37.5%) and distributed as follows (35.41%, 2.08% , respectively). As for 96 samples were examined for the E.coli that cause diarrhea, and the infection rates were (26.04%) in routine examination of bacteria. Depending on the PCR technique, the highest rates of infection were shown in rural areas for parasites and E.coli that cause diarrhea, where the highest percentage of parasites recorded(41.1%), while the highest percentage of E.coli infection was(28%). The percentage decreased in urban areas for parasites and E.coli, where the lowest percentage of parasites recorded (33.33%), The lowest percentage of E.coli (23.91%). Depending on the PCR technique, the highest infection rates were shown in males (39.2%), while the infection rate decreased in females (35.5%) for parasites. As for E. coli , the study recorded an increase in the infection rate in females (31.7%), while the rate of infection decreased Infection in males (21.81%), this study recorded the highest infection rate in the age group (6-10 years), (50%), while decreaseing in the infection rate was in the age group (21 years and over) (10%) for parasites. As for E.coli, the study also recorded an increase in the rate of infection in the age group (6-10) (35.29%), while the study decreased in the age group (21 years and over) (10%). For parasites, the highest infection rates were in the presence of animals in homes (39.4%), while the infection rates decreased in the absence of animals in houses 36.2%. The study found that the highest rates of infection were for those who have a head of the family with a primary education (50%), while the rates of infection decreased with the head of the family who obtain an academic education level (10%), and the highest infection rates were recorded in October 2021 (45%). ) The remaining months recorded similar rates, as they recorded (35.2%, 35.4%, 35.6%, 35.7%) (January 2022, November 2021, February 2022, December 2021, respectively). As for the type of infection with parasites and E.coli, the single infection was the highest percentage in this group (81.13%), the E.histolytica constituted (60.46%).The G.lamblia constituted (2.32%), and the E.coli accounted for (37.2%) for the single infection. Whereas the double infection (18.86%).The parasite E.histolytica with E.coli constituted (90%), while the parasite G.lamblia with E.coli constituted (10%). No triple infection was recorded in this study. Through the current study, it was concluded that the prevalence of parasites that cause diarrhea in Babylon province was very high through detection by microscopic and molecular methods (PCR method), compared with previous studies and rural areas had higher rates of infection than urban areas. Eight random positive samples of the PCR product in the current study were sent to Macrogen Company in South Korea for the purpose of determining the DNA sequence of parasites (E.histolytica , G.lamblia) and bacteria (E.coli ),and this study was identified and genetically recorded in the NCBI gene bank .The results of the study showed that all the transmitted isolates are identical to the NCBI gene bank isolates.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب