التشخيص المصلي والجزيئي لبعض فايروسات الجنس Allium ومقاومتها إحيائياً

الباحث

فرحان جاسم صران الشمري

المشرف

حميد حمود علي

الجامعة

جامعة الموصل

الكلية / القسم

كلية الزراعة والغابات / وقاية النبات

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

عربي

الكلمات المفتاحية

فايروسات النبات; الثوميات; التشخيص الجزيئي; المقاومة الإحيائية

أجريت هذه الدراسة للتحري عن أهم الفايروسات التي تصيب محاصيل الجنس Allium .8 إذ تم ela! المسح الحقلي لموسم عام 2021 في أغلب مناطق زراعة تلك النباتات في محافظة نينوى ، ضمت arf مناطق رئيسة مشهورة بزراعة محاصيل البصل a silly والكراث هي ( ربيعة ، الحمدانية ، بعشيقة ، قضاء الموصل ). عبر الزيارات الحقلية وشوهدت مظاهر الإصابة الفايروسية وبصورة متكررة على نباتات الجنس Allium spp. وتباينت تلك الأعراض ودرجة وضوحها باختلاف النباتات ، فقد سجلت على نباتات البصل أعراض اصفرار عام على الأوراق مصحوبة بتشوهها الاوراق والتفافها مع تخططها وتقزمها أما نباتات الكراث والثوم فأهم أعراضها كانت متمثلة باصفرار عام مع تخططها . ولقد أكد الاختبار المصلي الاليزا الثنائية Gb DAS-ELISA الأعراض المذكورة Wil مرتبطة مع الإصابة بفايروس اصفرار وتقزم البصل Onion yellow dwarf virus ، وبفايروس التخطط الأصفر على الكراث Leek yellow strip virus إذ أوضحت نتائج الاختبار المصلي للعينات الفردية والانتقائية على المحاصيل الثلاثة ( بصل ، ثوم ، كراث ) إصابة 107 عينة من إجمالي 385 عينة مختبرة بالاليزا بفايروس اصفرار وتقزم البصلء، ولقد وصلت نسبة الإصابة مجتمعة إلى 27.7 % على مستوى المحافظة. ووصل أعلى تركيز لفايروس Onion yellow dwarf virus في نباتات hadi إذ dad أعلى معدل للامتصاصية الضوئية (1.© لثلاث قراءات بجهاز spectrophotometer بلغ 0.490 مقارنة بقراءة الامتصاصية لعينة السيطرة المصابة 0.130 نانوميترء في حين وصلت نسبة الإصابة مجتمعة في الأنواع الثلاثة (البصل والثوم والكراث) بفايروس الاصفرار المخطط على الكراث إلى 618.1؟ ، وعلى مستوى مناطق المسح سجلت إصابة 70 عينة من إجمالي 385 عينة مختبرة بالاليزا بفايروس الاصفرار المخطط على الكراث ، وسجلت أعلى نسبة للإصابة بهذا الفايروس على الثوم 23.7 90 . تم عزل الحامض النووي الرايبي ال RNA لفايروس Onion yellow dwarf virus بنجاح من أوراق نباتات (البصل والثوم والكراث) ومن بصيلات نبات البصل المصابة بالفايروس بنجاح ، إذ تم الحصول على كمية مناسبة من الحامض النووي تراوحت بين 459.7 - 2780.2 نانوغرام/مايكروليتر، وينقاوة وصلت إلى 1.76- 1.8 ، وقُدّرت نقاوته باستعمال Nanodrop ،technique وأثبتت طريقة العمود اللاقط Spin column بالاعتماد على أعمدة تحوي على أغشية من السليكا silica membrane في كفاءتها العالية في عملية ريط المادة الوراثية المستهدفة، تمكنت تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل ذا النسخ العكسي RT-PCR على عينات ال | سمس ey) RNA بعد تحويلها إلى المتمم الدنا CDNA والمستخلصة من أوراق نبات (البصل والثوم والكراث) وبصيلات li البصل المصابة بفايروس Onion yellow dwarf virus مع البادئات المصممة ASSL عن فايروس Onion yellow dwarf virus التي تعمل على مناطق مستهدفة من الجين الفايروسي وهي منطقة الغلاف البروتيني (CP) ومنطقة الأجسام الضامة النووية (Nib) . ولقد بينت نتائج تحليل التباين الوراثي Gb فايروس اصفرار وتقزم البصل كان أكثر الفايروسات شيوعا في عينات الجنس Allium المدروسة، وبلغت نسبة التشابه الوراثي بين سلالة الفايروس المحلية والسلالات العالمية عالية جدا ٠ وذلك عبر نتائج التحليل الوراثي وأن هذا التشخيص أكد أن العلاقة الوراثية عالية جدا ما بين السلالة العراقية والسلالات العالمية GAY! ، أذ توافق التحليل الوراثي مع هذا التشخيص عبر وضع الفايروس في نفس الفرع ومشاركته نفس النسب مع العديد من السلالات الأخرى التي تعود إلى الفايروس نفسه بشكل رئيس. لوحظ تفوق معاملة gud البصل البكتريا subtillis .8 ولمدة تعريض 60 دقيقة وذلك بزيادة أطوال النباتات مقارنة بالنباتات غير المعاملة بالبكتردا وغير المعداة بالفايروسء، إذ وصلت متوسط أطوال النباتات إلى 49.5 سم ء كذلك وجدت فروق معنوية بينها وبين المعاملة بالبكتريا fluorescens ولمدتي المعاملة بها سواء 30 أو 60 دقيقة ، ولقد سببت العدوى بفايروس اصفرار وتقزم البصل على نباتات البصل خفضاً في ارتفاع النبات مقارنة بتلك التي عوملت فسقها بالبكتريا ولكلا النوعين Gus كانت أطوال النباتات المعداة بالفايروس 26.23 سم. في حين حققت معاملة Gud البصل بالبكتريا P. fluorescens إلى أفضل زيادة في الوزن الجاف والرطب للمجموع الخضري للنباتات، مقارنة بالنباتات التي لم تعامل بالبكتريا ally تلقح بالفايروسء إذ بلغ الوزن الجاف والرطب في النباتات النامية من Gud معاملة بالبكتريا fluorescens . 2/ ولمدة تعريض 60 دقيقة إلى 0.162 ، 2.5 غم على التوالي ٠ أما في النباتات التي لم تعامل فسقها بالبكتريا والمعداة بالفايروس فلقد وصل متوسط معاملات الوزن الجاف إلى 0.12 غم في حين وصل الوزن الرطب إلى 0.67غم.

This study was conducted to investigate the most important viruses that infect crops of the genus Allium spp. As a field survey was conducted for the 2021 season in most of the areas of cultivation of these plants in Nineveh Governorate, which included four main areas famous for the cultivation of onions, garlic and leeks (Rabea, Hamdaniya, Bashiga and Mosul district). Through field visits, manifestations of viral infection were repeatedly observed on plants of the genus Allium spp. These symptoms and their degree of clarity varied according to different plants. On onion plants, symptoms of general yellowing of the leaves were accompanied by distortion of leaves and corrugated with streaks and dwarfing. As for leek and garlic plants, the most important symptoms were represented by general yellowing and streaks. The serological test DAS-ELISA confirmed that the aforementioned symptoms are associated with infection with Onion yellow dwarf virus OYDV, and leeks yellow streak virus LYSV. A total of 385 samples was tested by DAS-ELISA with Onion yellow dwarf virus, the level combined infection rate reached 27.7% at the governorate. The highest concentration of OYDV virus in onion plants was recorded, as the highest rate of optical absorbance O.D was recorded for three readings with a spectrophotometer to 0.490 compared to the absorbance reading for the infected control sample 0.130 nm. While the combined infection rate of the three types (onion, garlic and leeks) with the leek yellow stripe virus was reached 18.1% and at the level of the survey areas, where 70 samples out of a total of 385 samples tested at DAS- ELISA were recorded with the leek yellow stripe virus, as the highest percentage of infection with this virus was recorded on Garlic 23.7%. The RNA of OYDV virus was successfully isolated from leaves of plants (onions, garlic and leeks) and from onion bulbs infected with the virus. a ا ملل Its purity is estimated using Nanodrop-test. The spin column method, based on columns containing silica membranes, proved its high efficiency in the process of binding the target genetic material. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) technology was able to convert RNA samples to cDNA extracted from leaves of plants (onions, garlic and leeks) and onion bulbs infected with OYDV virus with primers designed to detect OYDV virus that act on target areas of the viral gene is the protein coat region (CP) and the region of the nuclear inclusion bodies (Nib). The results of the phylogeny analysis showed that the onion yellow dwarf virus was the most common virus in the studied samples of the genus Allium, and the percentage of genetic similarity between the local strain of the virus and the global strains was very high, through the results of the genetic analysis, and that this diagnosis confirmed that the genetic relationship is very high between The Iraqi strain and other international strains, where the genetic analysis agreed with this diagnosis by placing the virus in the same branch and sharing the same proportions with many other strains that mainly belong to the same virus. It was noted that the treatment of onion rot with Bacillus subtillis and for an exposure period of 60 minutes resulted in an increase in plant heights compared to plants not treated with bacteria and not infected with the virus. Either 30 or 60 minutes, and infection with Onion yellow dwarf virus on onion plants caused a decrease in plant height compared to those treated with bacteria and for both types, where the lengths of plants infected with the virus were 26.23 cm. While the treatment of onion rot with Pseudomonas fluorescens achieved the best increase in the dry and wet weight of the vegetative total of plants, compared to plants that were not treated with bacteria and were not inoculated with the virus, as the dry and wet weight reached in plants grown from seeds treated with bacteria P. fluorescens for an exposure period of 60 minutes to 0.162 and 2.5 g, respectively, while in plants whose seeds were not b

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب