الحدوث والتوصيف الجزيئي للبكتريا سالبة غرام المنتجة للميتالو بيتالاكتاميز المعزولة من عدوى القدم السكري في النجف

Occurrence and Molecular Characterization of Metallo-Beta-Lactamases (MBL) Producing Gram Negative Bacteria Isolated from Diabetic Foot Infection in Najaf
البحث في الرسائل
الباحث
هدى زهير وحيد
المشرف
د. زينب جبار هادي
الجامعة
جامعة الكوفة
الكلية / القسم
الطب / الأحياء المجهرية الطبية
الشهادة
ماجستير
السنة
2022
لغة الرسالة
انكليزي
الكلمات المفتاحية
Metallo-Beta-Lactamase;Gram Negative Bacteria;Diabetic Foot Infection;Molecular Characterization

الملخص

تعرف عدوى القدم السكري بأنها آفات مزمنة غير قابلة للشفاء تؤدي إلى بطء واطالة عملية الشفاء. غالبية الآفات في المرضى الذين يعانون من التهابات مزمنة كانت البكتيريا السالبة لصبغة جرام. لذلك كان الغرض من الدراسة الحالية هو الكشف عن وجود البكتيريا السالبة لصبغة جرام المنتجة للميتالو بيتالاكتاميز المعزلة من المرضى الذين يعانون من عدوى القدم السكري. تم جمع (111) مسحة في الدراسة الحالية من مرضى السكري المصابين بتقرح القدم خلال الفترة من كانون الأول (ديسمبر) 2021 الى اذار (مارس) 2022 من مستشفى الصدر في محافظة النجف و المختبرات الخاصة من كلا الجنسين الذكو و GLY الذين تتراوح أعمارهم بين (20-اكثر من70 ) سنة. اشارت النتائج الى انه 93 (9083.8) كانت إيجابية لوجود النمو البكتيري(النمو واحد كان 82 مسحة و النمو المختلط كان 11 ،(Annes و18 (9/016.2) كانت سلبية لوجود النمو البكتيري. وكان معظم المصابين في هذه الدراسة من الذكور 0 )%63.1( اكثر من GLY! 41 (97037). اكثر نمو بكتيري كان يوجد في الفئات العمرية 63-53 سنوات (العدد5 38:3 %( من بين 93 عزلة بكتيرية كان هناك 69 )%74.1( عزله بكتيريا سالبة غرام و 35 )%38( عزله بكتيريا موجبة غرام. أظهرت النتائج ان معظم انواع البكتريا السالبة لصبغة غرام التي تسبب عدوى القدم السكري هي P.aeruginosa 20( %28.9( تليها الاشريشا القولونية 19 )%27.5( , Proteus spp. ,(%10.1) 7 K.pneumoina — ,(%18.8) 13 A.baumannii 4 )%5.8( Serratia spp. ,(%4.3) 3 Citrobacter spp. 2 )%2.8(, و L .adecarboxylata 1 )%1.4( تم اجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية ل 69 عزله سالبة لصبغة غرام واستخدم حوالي 23 قرص من المضادات الحيوية باستخدام طريقة الانتشار القرصي (كريبي بور). وفقا لاصدار 0151© , Sebi النتائج ارتفاع معدل المقاومة لمجموعات البنسلين و معظم أجيال السيفالوسبورينات والتتراسيكلين و النيتروفورانتوين. بينما كانت هناك مقاومة معتدلة للمضادات الحيوية الفلوروكينولون ( ليفوفلوكساسين و نورفلوكساسين ) ومقاومة منخفضة للمضادات الحيوية الكاربابينيم ( ايميبينيم ). اشارت النتائج الى ان معظم العزلات كانت حساسة للمضادات الحيوية امينوكلايكوسايد ( اميكاسين ) و الكوليستين, وكانت هذه المضادات هي الأكثر فعالية ضد العزلات البكتيرية. Gass النتائج أيضا, ان 31 )%45( من العزلات كانت متعددة المقاومة للمضادات, و 30 )43.4 %( من العزلات كانت مفرطة المقاومة للمضادات, و 8 )%12( كانت مقاومة لكل المضادات. حيث ان المقاومة لكل المضادات الذي وجد في Citrobacter spp. و Serratia Sake spp. اول بلاغ لهذه العزلات في Chall بين مرضى القدم السكري. اظهر اختبار الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات P.aeruginosa ان مستويات المقاومة العالية موجودة في الامبيسلين والنيتروفورانتوين و معظم أجيال السيفالوسبورين, في حين ان مستويات الحساسية القصوى للمضادات الحيوية امينوغليكوزيدات (اميكاسين و جنتاميسين) ومضادات الحيوية الكاربابينيم (اميبينيم وميروبينيم ) و البيبراسيلين-تازوبكتم. كما أظهرت النتائج ان 9 (045,؟) و 6 (030/) و 5 )%25( من عزلات ال ( Paeruginosa ) كانت متعددة المقاومة للمضادات, مفرطة المقاومة للمضادات, و مقاومة لكل المضادات , على التوالي. تبين ان اختبار الحساسية للمضادات الحيوية لعزلات الاشريشا القولونية ان مستويات المقاومة العالية موجودة في مجموعة البنسلين و السيفالوسبورين و الفلوروكينولون و النيتروفورانتوين و التتراسيكلين , بينما اقصى مستويات الحساسية توجد في الكوليستين و مضادات الحيوية للكاربابينيم ( اميبينيم ) و اموكسيسيلين- كلافولانيك اسيد. LS أظهرت النتائج ان %37)7( عزله كانت متعددة المقاومة للمضادات؛ و %63.1)12( عزله كانت مفرطة المقاومة للمضادات الحيوية. اظهر اختبار الحساسية للمضادات الحيوية لعز لات A baumannii ان مستويات المقاومة العالية موجودة في مجموعة البنسلين و السيفالوسبورين و الفلوروكينولون و النيتروفورانتوين و التتراسيكلين و الكلورامفينيكول, بينما اقصى مستويات الحساسية توجد في الكوليستين و مضادات الحيوية للكاربابينيم ( اميبينيم و ميروبينيم ). كما أظهرت النتائج ان %38.5)5( عزله كانت متعددة المقاومة للمضادات؛ و 8 )%62( عزله كانت مفرطة المقاومة للمضادات الحيوية. في الدراسة الحالية استخدمت تقنية تفاعل انزيم البلمرة المتسلسل لتحديد الجينات المسؤولة عن مقاومة المضادات الحيوية, اشارت النتائج الى ان 28 عزلة سالبة عرام مقاومة للكاربابينيم تم فحصها لوجود جينات الميتالوبيتالكتاميز و جينات البيتا لاكتام واسعة الطيف. أظهرت هذه النتجة وجود ثلاث جينات فقط من جينات الميتالو( blanpM ,%14.3 blasim ,%10.7 blavim 9014.3 )في ثلاث أنواع من العزلات السالبة غرام blacim blaspm, blame ( iz. ( Citrobacter braaki , P.aeruginosa , E.coli) ) لم يتم العثور عليها في أي عزلة. أظهرت النتائج Gedy Lad جينات البيتالاكتام واسعة الطيف ان معدلات انتشار هذه الجينات كانت توجد في جميع 28 عزلة سالبة غرام المقاومة للكاربابنيم blasuv_,( 43% (12 blactx-m ,( 60% (17 blaoxa 4 14.396 ) بينا كان جين ( 7147721 ) غير موجود في أي عزلة نستنتج من خلال نتائج الدراسة الحالية الى ان العدوى تحدث لدى الذكور اكثر من الاناث و غالبية هذه العدوات حدثت في الفئات العمرية )63-53 ). وكانت P.aeruginosa و :17,001 هي السائدة في العزلات السالبة لصبغة غرام بين مرضى الذين يعانون من عدوى القدم السكري A-baumannii ‘et وهنالك ارتفاع في نسبة متعددة المقاومة ( MDR ) و مفرطة المقاومة ( (XDR_ و مقاومة لكل المضادات الحيوية ) PDR ) بين العزلات, وحيث ان المقاومة لكل المضادات الذي وجد في Citrobacter spp. و Serratia spp. يعتبر اول بلاغ لهذه العزلات في النجف بين مرضى القدم السكري. و كذالك أظهرت الدراسة أيضا عن وجود جينات الميتالو و جينات البيتالاكتاميز واسعة الطيف بين العزلات .

Abstract

Diabetic foot infection (DFI) was defined as chronic, non-healing lesions that a sluggish and prolonged healing process. The majority of lesions in patients with chronic infections were Gram-negative bacteria. Therefore, the purpose of current study was undertaken to detect the presence of MBL-producing Gram -negative bacteria isolates from the patients with diabetic foot infection. In the current study the total number of 111 swabs were collected from diabetic patients with foot infection during the period of December 2021 to March 2022 from Al-Sadder Hospital in Najaf Province and private laboratory from both male and female with age ranged between (20 -≥70) years. The results indicated that 93 (83.8%) were showed bacterial growth (single growth 82 swabs and mixed growth 11 swabs) and 18 (16.2%) were negative bacterial growth, there was most patient in this study was male 70 (63.1%) more than female 41 (37%). The maximum bacteria growth found in age groups 53-63 years (n=35; 38%). 69 (74.1%) out of 93 isolates were Gram-negative bacteria and 35 (38%) out of 93 isolates were Gram-positive bacteria. The result revealed that most species of Gram-negative that cause DFI is P. aeruginosa represent that about 20 (28.9%) followed by E. coli 19 (27.5%), A. baumannii 13 (18.8%), K. pneumoniae 7 (10.1%), Proteus spp. 4 (5.8%), Citrobacter spp. 3 (4.3%), Serratia spp. 2 (2.8%), and L. adecarboxylata 1 (1.4%). The antibiotic susceptibility test was performed for 69 Gram-negative isolates used about 23 disks of antibiotics by using disk diffusion method (Kirby-Bure). According to CLSI, the results revealed that high resistance rate to penicillin groups, most generations of the cephalosporins, tetracycline, and nitrofurantoin. There was a moderate resistance rate to fluoroquinolone antibiotic (levofloxacin and norfloxacin) and a low resistance to carbapenem antibiotics (imipenem). The results indicated that most isolates were susceptible to aminoglycosides antibiotics (amikacin) and colistin, this antibiotic was most effective against bacterial isolates. The results also showed that 31 (45 %) of isolates were multidrug-resistant (MDR), 30 (43.4%) of isolates were extensive drug resistant (XDR), and 8 (12%) were pan drug resistant (PDR), PDR to Citrobacter spp. and Serratia spp. considered first reported in these isolates in Najaf among patient with DFI. The antibiotic susceptibility test of P.aeruginosa isolates revealed that high resistance levels found in ampicillin , nitrofurantoin, and most generation of cephalosporin, while the maximum sensitivity levels to aminoglycosides antibiotics (amikacin and gentamicin), carbapenem antibiotics (imipenem and meropenem), and piperacillin- tazobactam. The results also showed that 9 (45%), 6 (30%), and 5 (25%) of P.aeruginosa isolates were MDR, XDR, and PDR respectively. Antibiotic susceptibility test of E.coli isolates were highly resistant to penicillin group, cephalosporin, fluoroquinolone, nitrofurantoin, and tetracycline, while the maximum sensitivity levels to colistin, carbapenem antibiotics (imipenem), and amoxicillin-clavulanic acid. The results also showed that 7 (37%) of isolates were MDR and 12 (63.1%) XDR. The antibiotic susceptibility test of A.baumannii isolates showed that high resistance levels found in penicillin group, cephalosporin, fluoroquinolone , nitrofurantoin, tetracycline, and chloramphenicol, while the maximum sensitivity levels to colistin, carbapenem antibiotics (imipenem and meropenem). The results also showed that 5 (38.5%) of isolates were MDR and 8 (62%) XDR. In the current study PCR assay used to determine the genes that were responsible for antibiotics resistance, the results indicated that 28 carbapenem-resistance Gram negative isolates were screening to presence of MBL genes and ESBL genes. This result showed presence only three genes from MBL genes (10.7% blaVIM, 14.3% blaSIM, 14.3% blaNDM) in three types of Gram-negative isolates (E.coli, P.aeruginosa, Citrobacter braakii), while blaIMP, blaSPM, blaGIM were not found in any isolate. In the ESBL genes, the results showed that prevalence rates of these genes among all 28 carbapenem-resistance Gram-negative isolates blaOXA 17 (60 %), blaCTX-M 12 (43%), blaSHV 4 (14.3%) while blaTEM was not found in any isolate. In conclusion, the results of current study found that infections occur in male more than female and these infections frequency in age groups (53-63) years. P. aeruginosa and E. coli are predominant of Gram-negative isolates among patients with DFI and followed by A. baumannii, there was high prevalence of MDR, XDR, and PDR among isolates, and PDR to Citrobacter spp. and Serratia spp. considered first reported in these isolates in Najaf among patient with DFI. Also, there was the presence of MBL and ESBL genes among isolates.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.