تأثير تعدد أشكال جين TCF7L2 (rs7903146 و rs4506565) على مرضى السكري النوع الثاني في المجتمع العراقي في محافظة النجف

Impact of TCF7L2 Gene Polymorphism (rs7903146 and rs4506565) on Type 2 Diabetes Mellitus in Iraqi Population from Najaf Governorate
البحث في الرسائل
الباحث
عبد الله سامي عبد الله مزعل
المشرف
د. سيناء كاظم علي
الجامعة
جامعة الكوفة
الكلية / القسم
التربية للبنات / الكيمياء
الشهادة
ماجستير
السنة
2022
لغة الرسالة
انكليزي
الكلمات المفتاحية
TCF7L2;Gene Polymorphism;Type 2 Diabetes Mellitus;Najaf

الملخص

الخلفية: داء السكري من النوع 2 هو مرض معقد وغير متجانس له تاريخ متشابك. تم ربط داء السكري من النوع الثاني بعدد كبير من الجينات خلال العقود القليلة الماضية. يستخدم جين 062 ععامل نسخ على مستوى الجينوم والمواضع ، وتم اكتشاف أول جين مرشح مع داء السكري من النوع الثاني ، كما تم اكتشاف جين TCF7L2 بأعلى ارتباط مع داء السكري من النوع الثاني بين جميع الجينات التي تم تحديدها حتى الآن. الأهداف: هو البحث عن علاقة الطفرتين الوراثية )187903146( و )184506565( في موروثة جين (TCF7L2) مع ela السكري من النوع الثاني في المجتمع العراقي واثر هذه الطفرات على مؤشر كتلة الجسم و سكر الدم الاعتيادي والتراكمي ومقاومة الانسولين و حساسية الانسولين في السكان العرب العراقيين. طريقة العمل: شملت هذه الدراسة 100 مريض بداء السكري من النوع الثاني و 100 من الاصحاء تم اختيارهم عشوائيا استنادا إلى المبادئ التوجيهية لمنظمة الصحة العالمية .وتتضمن المقاييس التي تم حسابها مؤشر كتلة الجسم( (BMI ، مستوى السكر (FBS) ، سكر الدم التراكمي (HbA Ic) ، مقاومة الانسولين (HOMA-IR) وحساسية الانسولين .تم استخراج الحمض النووي من الدم وتم التنميط Al) sll باستخدام تقنية T-ARMS PCR للتركيب الجيني 2 لتعدد الأشكال 187903146 و 54506565.تم عزل الحمض النووي لمنتج الجين 02 منن الدم بالكامل وتم عزله باستخدام الجل الهلامي. تم تحليل البيانات باستخدام مجموعة متنوعة من الأساليب الإحصائية. النتائج: تم فصل النتيجة النهائية لموروثة جين 57903146 TCF7L2 بواسطة تقنية ARMS-PCR إلى ثلاثة حزم: bp) 429) للأليل الخارجي و bp) 269( للأليل © و 212) (مطللأليل '1'.هناك حزمتين فقط في النمط الجيني من النوع المتنحي bp) (CC) 429 و 269). تكونت ثلاثة حزم من النمط الهجين and 212 bp) (CT) ,269 ,429). يوجد حزمتين فقط في الأليل السائد and 212 bp) (TT) ,269 ,429). بينما تم فصل موروثة 24506565 لنفس الجين وبنفس الطريقة ( (ARMS-PCR لهذه العينات إلى ثلاثة حزم: bp 432 و bp 287 للأليل A ، و م6 194 بالنسبة للأليل '1. كانت هناك حزمتين فقط في النمط الجيني من النوع ا خلاصة السائد and 194 bp) (TT) 432). وهناك ثلاثة حزم من النمط الجيني الهجين (TA) and 194 bp) ,287 ,432). يمكن رؤية حزمتين فقط في ألاليل المتنحي (AA) and 287 bp) 432).تم العثور على ترددات النمط الوراثي للجين TCF7L2 للطفرة T/A 154506565 متوافقة مع معادلة هاردي_.وينبرغ بينما ، ترددات النمط الوراثي للجين 2 للطفرة C/T 787903146 انحرفت عن توازن هاردي وينبرغ .و عند اجراء مقارنة بين الاصحاء و المرضى المصابين بداء السكري من النوع الثاني ، يظهر النمط الوراثي للجين TCF7L2 للطفرة C/T 187903146 في النموذج المشفر OR=40.2333(95% Ge Cl: 6.0293 to 100.9850, 2 > 0.0001) يوجد خطر متزايد من داء السكري من النوع الثاني حوالي )40( مره مقارنةً مع النمط المتنحي (CC) بالنسبة للعمر والجنس ومؤشر كتلة الجسم. علاوة على ذلك 6 يوضح النمط السائد (TT) في نموذج الترميز OR=17.7500(95% CI: 6.0051 to 52.4659, P > 0.0001) مما يزيد من خطر الاصابة بداء السكري من النوع الثاني بحوالي )17( مره مقارنة بالنمط المتنحي (CC) تظهر المقارنة بين الاصحاء والمرضى المصابين بداء السكري من sill الثاني CT + TT في OR=31.8021(95% CI: 13.4618 to 75.1291, P > 0.0001) ، هناك خطر متزايد للإصابة بداء السكري من النوع الثاني بحوالي )31( مره مقارنة بالنموذج السائد. يمثل النمط الجيني الهجين CT مع )0.0001 > OR=13.9487 (95% CI: 6.8372 to 28.4569, P حيث يوجد خطر متزايد من داء السكري من sill & الثاني بحوالي )13.9( مره مقارنة ب (CC + CT) وعند المقارنة بين الاصحاء و مرضى السكري النوع الثاني في التركيب الوراثي للجين 1017712 T/A 754506565 لم يلاحظ أي اختلاف كبير في النماذج السائدة والمتنحية على التوالي. الاستنتاج:: وفقًا لنتائج هذه الدراسة ، يرتبط تعدد الأشكال الجيني )187903146( TCF7L2 بخطر الإصابة بداء السكري من النوع الثاني . تردد التنميط الجيني C/T 187903146 بين الذكور والإناث يوضح أنماطًا وراثية مهمة (T/T) و (© / ©) مع الجنس. تشير البيانات بوضوح إلى أن تعدد الأشكال الجيني )146 187903( TCF7L2 في المرضى العرب العراقيين قد يكون له دور في تطوير الاصابة بداء السكري من النوع الثاني. من ناحية أخرى ، فإن تواتر Lyall الجيني A / T) 184506565( بين الذكور والإناث أظهر طررًا وراثية معنوية (T/T) مع الجنس.

Abstract

Background: Type 2 diabetes is a complicated, heterogeneous disease with a tangled history. Over the last few decades, T2DM has been related to a large number of genes. TCF7L2 gene was discovered utilizing genome- wide screening and positional cloning as the first T2DM candidate gene. TCF7L2 gene also has the highest association with T2DM of all genes known to date. Aims: This aims at evaluating the influence of TCF7L2 gene polymorphisms (rs7903146) and (rs4506565) on BMI, FBG, HbA1c, HOMA-IR, and insulin sensitivity in Iraqi population from Najaf Governorate. Methods: The study included a total of 100 T2DM patients and 100 healthy controls. The phenotypic data includes body mass index (BMI), fasting blood sugar (FBS), HbA1c, and insulin levels. The rs7903146 and rs4506565 polymorphisms were genotyped using T-ARMS PCR. Whole blood DNA for the TCF7L2 gene product was extracted and electrophoresed on an agarose gel. A number of statistical methods were used to analyze the data. Results: The ARMS-PCR product of the TCF7L2 gene rs7903146 is divided into three bands: 429 bp for the outer PCR, 269 bp for allele C, and 212 bp for allele T. In the wild type genotype (CC), just two bands would be present (429 and 269 bp). Three hetero-genotype (CT) bands would be present (429, 269, and 212 bp). The mutant allele TT has just two bands (429 and 212 bp), whereas the ARMS-PCR output of these samples has three bands: 432 bp for the outer PCR, 287 bp for allele A, and 194 bp for allele T. In the wild-type genotype (TT), just two bands would be present (432 and 194 bp).Three bands of the hetero-genotype (TA) would be present (432, 287, and 194 bp). Only two bands would be seen in the mutant allele AA (432 and 287 bp).The genotype frequencies of gene TCF7L2 SNP (rs7903146 C/T) were not Consistent with Hardy–Weinberg equilibrium. While, SNP (rs4506565 T/A) are consistent with Hardy– Weinberg equilibrium. The comparison of control and T2DM the heterozygous genotype TCF7L2 SNP rs7903146 C/T in the codominant model shows OR=40.2333(95% CI: 6.0293 to 100.9850, P < 0.0001) in which there is an increased risk of T2DM about 40 folds in comparison with After adjusting for age, sex, and BMI, the wild type (CC) emerged. In Dominant model represents the comparison of control and T2DM shows CT+TT the OR=31.8021(95% CI: 13.4618 to 75.1291, P < 0.0001); hence, there is an increased risk of T2DM about 31 folds in comparison with wild type. Over Dominant model represents CT with OR=13.9487 (95% CI: 6.8372 to 28.4569, P < 0.0001) in which there is an increased risk of T2DM about 13.9 folds in comparison with (CC+CT). Results of genotype and allele frequency analysis of TCF7L2 gene polymorphism rs4506565 in control and T2DM patients represents no significant variation was observed in codominant, dominant, over dominant, recessive and additive models respectively. Conclusion: According to the findings of this study, the TCF7L2 gene polymorphism (rs7903146) is associated to the risk of T2DM. The data clearly imply that the TCF7L2 gene polymorphism (rs7903146) in Arabic Iraqi patients may have a role in the development of T2DM. Genotyping frequency of rs7903146 C/T among male and female demonstrates significant genotypes (T/T) and (C/C) with gender. On the other hand, Genotyping frequency of rs4506565 A/T among male and female demonstrated significant genotypes (T/T) with gender. The dominant model in TCF7L2 gene polymorphism SNP rs4506565 C/T has a significance with age but no significance with other parameters.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.