مقارنة ستة أصناف من نبات الباميا Abelmoschus esculentus (L.) من خلال بعض المؤشرات الجزيئية والبروتينية

Comparative of Six Okra (Abelmoschus esculentus (L.)) Varieties via Molecular and Protein Parameters
البحث في الرسائل
الباحث
نور سعيد عبيد
المشرف
أ.د. نضال عبد الحسين مسن البديري
الجامعة
جامعة الكوفة
الكلية / القسم
التربية للبنات / علوم الحياة
الشهادة
ماجستير
السنة
2022
لغة الرسالة
عربي
الكلمات المفتاحية
الباميا;المؤشرات الجزيئية;البروتينات;الأصناف

الملخص

أجريت الدراسة الحالية باستعمال التسلسلات المتكررة البسيطة Simple Sequence aud Repeats أصناف من Gli الباميا Abelmoschus esculentus (L.) ( لهلوية, حسيناوية , غزالة , سلطانة, كليميسون , بتيرة) تم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل صنف (أعدادها وأحجامها الجزيئية) بعد ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلام الأكآروز وتصبيغها ببروميد الاثيديوم. تم اختيار ٠١ بوادئ والتي أظهرت نواتج تضاعف متباينة بين التراكيب المدروسة وكان الحجم الجزيئي للحزم الناتجة كانت متنوعة لجميع التراكيب الوراثية لنبات الباميا وتراوحت بين )104 - 269( زوج قاعديء إذ سجل البادئ 55156 أقل حجم جزيئي إما أعلى حجم جزيئي فقد سجله البادئ 55192. كما ain النتائج ان SSR7s 55195 (salsa و5519 و55110 أعطت أقل ase من الاليلات وهو 1 بينما انتجت البوادئن 55121 SSR25 و5516 أكبر عدد من الاليلات وهو ؟ ، وان اقل نسبة لتكرار الاليل الرئيسي هي0.4286 للبادئ SSR2sSSR1) و 55163 و (SSR4 بينما أعلى نسبة لتكرار الاليل الرئيسي هي 1.0000 للبوادئ 5515 و5517 و SSR10s 9 . كذلك أن هناك بعض البوادئ لم تعط قيمة للتغاير وهي 55152 و5515 و5517 او 9 55110 في حين كانت أعلى قيمة للتغاير الوراثئي 0.4286 للبادئ 55126 ؛ AS للبوادئ 55125 و5517 و5519 SSR10s لم يعطيا أي قيمة للتنوع الوراثئي في حين أن أعلى قيمة كانت هي 0.7551 للبادئن 5514 وأن محتوى المعلومات متعددة الأشكال تراوح ب 2333333 دت>-2ت هكم بين اقل قيمة هي ,0.0000 للبوادئ 55165 SSR7s و55168 و5519 و551510. lax أعلى قيمة هي 0.7298 للبادئ SSR4 واظهرت النتائج اعلى نسبة تشابه التي تقابل dal بعد وراثي هو (0.2304) بين التركيبين (4) سلطانة و (5) كليميسون اسودء في حين كان اقل نسبة من تشابه الوراثي التي يقابل أكبر بعد وراثي هو(0.7479) بين التركيبين )1( لهلوبة 5 )0( كليميسون اسود. وكانت نتائج التحليل التجميعي التي تظهر على شكل شجرة Dendrogram (شجرة العلاقة الوراثية) إلى مجموعتين وراثيتين رئيسيتين ضمت المجموعة الأولى ثلاث تراكيب هي لهلوبة وحسيناوية وغزالية والمجموعة الثانية ضمت ايضا ثلاث تراكيب هي سلطانة وكليميسون اسود ويتيرة (بامية بغداد). Lal الدراسة البروتينية، أظهرت النتائج بصمة منفردة ومميزة لكل تركيب وراثي وأن نسبة التغاير (الاختلاف) بين التراكيب لهلوبة وكليمسون اسود بلغت ”907 مما يدل ان نسبه التمائل (التشابه) بين الصنفين سلطانة وكايمسون اسود /9615. تعد الدراسة الحالية هي الأولى من نوعها في تحديد التسلسل النيوكليوتيدي لناتج الحامض النووي المضاعف لنبات الباميا وأظهرت نتائج تحليل تسلسل القواعد النيتروجينية لنواتج PCR products المضاعفة وياستعمال برنامج Basic Local Alignment Search (BLAST)Tool وان جميع التراكيب الوراثية المشخصة هي Baile إلى نفس الجنس Me بينت الدراسة وجود تباين وراثي فيما بينها من جهة وبين التراكيب الوراثية الاخرى العائدة للنبات نفسه والمثبتة في قاعدة بيانات المركز الوطني لمعلومات التقنية الحياتية National -Center for Biotechnology Information (NCBI).

Abstract

e current study was conducted using Simple Sequence Repeats for six okra genotypes. The discrepancies between the replicates of each cultivar (their numbers and molecular sizes) were revealed after the replicates of the samples were migrated onto agarose gel and stained with ethidium bromide. 10 primers were selected, which showed different doubling products among the studied structures, and the molecular size of the resulting bundles was varied for all okra plant genotypes and ranged between (104-269) base pairs, where primer SSR6 recorded the lowest molecular size or the highest molecular size was recorded by the initiator SSR8. The results also showed that the primers SSR5, SSR7, SSR9, and SSR10 gave the lowest number of alleles, which is 1, while the primers SSR1, SSR2, and SSR6 produced the largest number of alleles, which is 4, and that the lowest frequency of the main allele is 0.4286 for primers (SSR1, SSR2, SSR3, and SSR4), while the highest The major allele frequency ratio is 1.0000 for the primers SSR5, SSR7, SSR9 and SSR10. Also, there are some primers that did not give a value for heterogeneity, namely SSR2, SSR5, SSR7, SSR9 and SSR10, while the highest value for genetic variation was 0.4286 for primer SSR6, as well as for the primers SSR5, SSR7, SSR9 and SSR10, which did not give any value for genetic diversity, while the highest value was 0.7551 for the SSR4 primer and that the polymorphic information content ranged between the lowest value of 0.0000, for the SSR5, SSR7, SSR8, SSR9 and SSR10 primers. While the highest value is 0.7298 for the primer SSR4. The results showed the highest percentage of similarity that corresponds to the lowest genetic distance is (0.2304) between the two structures (4) Sultana and (5) Black Clemison, while the lowest percentage of genetic similarity that corresponds to B the largest genetic distance is (0.7479) between the two structures (1) lahloba and (5) a black Clemison. The results of the synthesis analysis, which appear in the form of a dendrogram (the tree of genetic relationship) into two main genetic groups, the first group included three structures, which are Lahloba, Husseinawiya and Ghazaliya, and the second group also included three structures, namely Sultana, Black Clemison and Batira (Baghdad okra). As for the protein profile study, the results showed a unique and distinct fingerprint for each genotype, and the percentage of heterogeneity (difference) between the structures amounted to 32%, which indicates that the percentage of similarity is 68%. The current study is the first of its kind to determine the nucleotide sequence of the double-stranded DNA product of the Sunflower blight gene. The results of the sequence analysis of the PCR products using the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) showed that all the diagnosed genotypes belong to the same genus. The study showed the presence of genetic variation between it on the one hand and other genotypes belonging to the same plant that are installed in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) database.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.