التنميط الجزيئي لجراثيم السالمونيلا المعوية المعزولة من لحوم الدواجن المجمدة في الأسواق المحلية

الباحث

غفران جواد كريم

المشرف

أ.م.د. علي هادي عباس

الجامعة

جامعة الكوفة

الكلية / القسم

الطب البيطري / الأحياء المجهرية البيطرية

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

انكليزي

الكلمات المفتاحية

Salmonella enterica;Molecular Serotyping;Frozen Poultry Meat;Food Safety

السالمونيلا كائنات حية دقيقة تسبب الأمراض التي تنقلها الأغذية وتنتشر على نطاق واسع في الطبيعة. أصبح ظهور السالمونيلا المقاومة للأدوية المتعددة وتداولها المستمر مشكلة في العديد من المناطق الموبوءة. تهدف هذه الأطروحة إلى التحقيق في جوانب التركيب السكاني لأنواع السالمونيلا باستخدام تقنية جزيئية جديدة ، وأنماط وراثية في لحوم الدجاج المجمدة عن طريق تسلسل هدف جينومي عالمي ، وتحديد نمط مقاومة البكتيريا لهذه العزلات. أجريت دراسة مقطعية لجمع 160 عينة من لحوم الدجاج المجمدة خلال الأشهر من أكتوبر 0 إلى ديسمبر 2020 ، منها 30 كبد و 49 دجاجة كاملة و 25 فخدًا و 56 صدرًا في محافظة النجف. تم إجراء الاختبارات المظهرية والكيميائية الحيوية على العينات التي تم جمعها. اختبارات السالمونيلا ، متبوعة بالتقنيات المعمول بها للتعرف على البكتيريا. متبوعًا بالتعريف الجزيئي ، تعرضت العزلات لتفاعل البلمرة المتسلسل مع بادئات معينة تستهدف منطقة جينومية ؛ مشغل TINH أوضح الاختبار الجزيئي أن المعدل المرتفع للغاية لعزلات السالمونيلا 40 )7100( يحتوي على المنطقة الجينومية لأوبون rynH في غضون ذلك ¢ كشف التحليل التسلسلي عن وجود نمطين Gules في لحوم الدجاج المجمدة. Infantis .5 و Enteritidis .5 ، على التوالي ، بمعدل انتشار 39 )788( و 1 )22.2( ومع ذلك ، تم تضخيم نوعين من البكتيريا غير السالمونيلا ، وهما Citrobacter freundii و Enterobacter cloacae ، ولكن يسهل تمييزهما عن سلالات السالمونيلا بمعدلات انتشار 2 )24.5( و 2 )74.5( على التوالي. أظهرت النتائج وجود فرق معنوي بين العينات التي تم جمعها والعزلة الإيجابية من هذه العينات ، مع تقييم الدلالة عند مستوى القيمة P (0.01> 2) .

Salmonella is a zoonotic organism that cause food-borne disease and is widely disseminated in nature. The emergence and continuous circulation of multi-drug resistant Salmonella have become problematic in many endemic regions. This study aimed to investigate aspects of the population structure of Salmonella species using new molecular technique, and genotypes in frozen chicken meat by sequencing a global genomic target, and determining the antibacterial resistant pattern of these isolates. A cross-sectional study was conducted to collect 160 samples from frozen chicken meat during the months of October 2020 to December 2020, including 30 livers, 49 complete chickens, 25 thighs, and 56 breasts, in the Najaf province. Phenotypic and biochemical tests were performed on the collected samples. Salmonella tests is Triple Sugar Iron (TSA) and Urease test, followed by established techniques to identify the bacteria. Followed by molecular identification, the isolates were subjected to polymerase chain reaction with particular primers targeting a genomic region; operon rrnH. The molecular test indicated that an extremely high rate of Salmonella isolates 40 (100%) was containing the genomic region of rrnH operon. Meanwhile, sequencing analysis revealed the presence of two serotypes in frozen chicken meat. S. Infantis and S. Enteritidis, respectively, with a prevalence rate of 39 (88%) and 1 (2.2%). However, two non-Salmonella bacteria, Citrobacter freundii and Enterobacter cloacae specific regions, were amplified, but easily distinguished from Salmonella strains, with prevalence rates of 2 (4.5%) and 2 (4.5%), respectively. The results revealed a significant difference between the collected samples and the positive isolation from these samples, with the significance evaluated at the P value level ( p<0.01). Disk diffusion method of bacterial susceptibility testing to antibiotics was performed on Salmonella isolates, it revealed significant levels of resistance to the following antibiotics: tetracycline 04 (100%), ampicillin 53 (87.5%), nalidixic acid 39 (97.5%), erythromycin 04 (100%), sulfamethoxazole 39 (97.5%), ciprofloxacin 34 (85%), trimethoprim 31(77.5%), Chloramphenicol 25 (62.5%), ceftriaxone 28 (70%), gentamicin 28 (70%), amikacin 36 (90%), cephalexin 04 (100%), and amoxicillin 29 (72.5%). The statistical analysis of these resistance rates was significantly high (P ˂0.01). Remarkably, the multidrug resistance profile indicated that 50 (100%) of them were extensive drug resistance strains. This study denoted a high prevalence of human pathogenic Salmonella strains with multi-drug resistance to different antibiotics present in chicken meat, which shed the light on this food source as a potential of causing public health issues.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب