التشخيص الجزيئي للأنماط الجينية لفايروس الورم الحليمي البشري عند النساء المصابات بالثآليل التناسلية في مدينة الموصل
Molecular Diagnosis of Human Papilloma Virus (HPV) Genotypes from Women with Genital Warts in Mosul City
- الباحث
- غفران محمد جاسم حسن العزاوي
- المشرف
- انمار احمد داؤد سليمان الطائي
- الجامعة
- جامعة الموصل
- الكلية / القسم
- كلية العلوم / قسم علوم الحياة
- الشهادة
- ماجستير
- السنة
- 2024
- لغة الرسالة
- انكليزي
- الكلمات المفتاحية
- Human Papilloma Virus ; HPV Genotypes ; Genital Warts ; Molecular Diagnosis
الملخص
هدفت الدراسة الحالية الى دراسة توزيع وانتشار فيروس الورم الحليمي البشري لدى النساء المصابات بالثاليل التناسلية المختلفة في مدينة الموصل في العراق والتحري عن الحمض النووي للفيروس بتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) بالاضافة الى تحليل التسلسل للجين المضخم (HPV )11 و مقارنته بالجين الموجود في المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) .كما تهدف الدراسة ايضا الى تحليل الشجرة الوراثية التطورية لمقارنة التسلسلات الحالية مع أنماط جينية مماثلة في مصرف الجينات NCBI) ) باستخدام برنامج تحليل الوراثة التطوري الجزيئي (7 (MEGA والتحري عن مستضد الفيروس باستخدام فحص المقايسة الامتصاصيه المناعيه 324 (CELTS A )az تم جمع مائة وخمسين عينة تضمنت Clie نسيجية ومسحات لعنق الرحم وفرشات من عنق الرحم وعينات مصل الدم من مستشفى الزهراوي الاهلي و مستشفى الموصل العام ومستشفيات اخرى تابعة لمدينة الموصل للفترة من شهر اب لسنة 2023 الى شهر نيسان لسنة 2024 . وقد تراوحت اعمار المرضى من 58-19 سنة وتم تصنيفهم إلى أربع SUG عمرية حيث تم التحري عن وجود الحمض النووي لفيروس HPV في جميع العينات باستخدام بادئات الجينين MY09/MY11 450 bp GP+5/4+6 150 bps والتي اجريت في المختبر المركزي لجامعة الموصل في كلية العلوم. وتم بعد ذلك عزل وتشخيص مائة وسبع وعشرين نمط جيني للفيروس 90 84.6 وقد لوحظت اعلى النسب 3290 و 0 في الفئات العمرية 28-19 و 38-29 سنة . تطابقت عينات الفيروس مع تسلسلات النيوكليوتيدات المسجلة في المركز القومي لمعلوات التقانة الحيوية بنسبة %100-89 . ومن الارجح ان يكون لدى النساء المصابات بالثاليل التناسلية في مدينة الموصل في العراق انماط جينية مختلفة لفيروس HPV .من 84.6% كان %8 LLG الجينية عالية الخطورة Cus شملت 9,04 لكل من النمط الجيني 16 HPV و Leis HPV45 النسبة العالية كانت 9,092 للانماط الجينية واطئة الخطورة وشملت 60.590 للنمط الجيني 1125711 ، 20.59 للنمط الجيني HPV6 5 11% للنمط الجيني HPV10 . كشف تحليل الشجرة الوراثية التطورية عن وجود علاقة وراثية بين WY Je والعزلات العالمية تتراوح بين )%10 -%100( نسبة وهذا يدل على وجود علاقات تطورية (تباعد و تقارب) وهذا يعني التنوع في الأنماط الجينية للفيروس شائعة في الموصل في العراق. ولم تكن نتائج فحص المقايسة الامتصاصية المناعية للانزيم (ELISA) للتحري عن مستضد الفيروس مجدية حيث اظهرت نتائج سلبية لعينات مصل الدم ونسبة %3 لعينات النسيج لنفس المرضى اللذين اظهروا نتائج ايجابية ands تفاعل البلمرة المتسلسل.
Abstract
The current study aims to investigate the genotypic distribution and prevalence of Human Papillomavirus (HPV) from women with different genital warts in Mosul/Iraq . The HPV nucleic acid by Polymerase Chain Reaction (PCR), and the sequencing analysis of the amplified HPV L1 gene compared with that in the National Center for Biotechnology Information (NCBI). The study also aims to analyze the phylogenetic tree including the minimum spanning trees of the amplified HPV L1 gene to compare the present sequences with the similar genotypes in GenBank – NCBI using the Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) -11- software. The detection of the HPV antigen using the Enzyme-Linked Immune Sorbent Assay (ELISA) is another objective of the study. One hundred fifty samples were collected from women with genital warts infections and analyzed. The patients ranged from 19 to 58 years old and were classified into four age groups. The detection of HPV nucleic acid DNA was examined in all samples using the conventional PCR to amplify the HPV L1 gene using specific primers MY09/MY11 (450 bp) and GP+5/+6 (150 bp).The amplified HPVL1 sequences were sent to Macrogen (Macrogen Co., Seoul, Korea) for identification . Atotal of 127 (84.6%) of virus genotypes were isolated and identified. The HPV-positive results across all age groups with the highest frequency (32% and 28.6%) were observed in the 19–28 and 29–38 age groups respictively The isolated viruses have 89–100% sequence similarities with the nucleotide sequences recorded at the National Center for Biotechnology Information.The results showed that Women in Mosul/ Iraq who have genital warts were more likely to have different genotypes of HPV. Out of the 84.6% isolated samples, there was 92% of Low-Risk (LR-HPV) genotypes included 60.5% HPV11, 20.5% HPV6, and 11 % HPV10. The rest 8% with High-Risk (HR-HPV) genotypes including (4%) of each HPV (16 and 45). The were The analysis of the phylogenetic trees reveals genetic relationships between our isolates and global isolates ranging from (10% -100%) bootstrap ratio. This indicates a phylogenetic relationship (divergent and convergent evolution). This refers to the diversity of virus genotypes that were common in Mosul/Iraq. The immunological detection results by ELISA were not efficient in detecting the HPV antigen in sera or tissue samples, because of 127 PCR positive results, only 3% were positive in ELISA using tissue samples. However, there were no positive results in sera.
طلب نسخة من الملف
الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.