تشخيص الجين المشفر لإنزيم Auto Inducer Synthase التلقائي في بكتريا Acinetobacter baumannii المكونة للأغشية الحيوية
Identification of an Auto Inducer Synthase Encoding Gene in Biofilm Forming Acinetobacter baumannii
- الباحث
- اميرة اسماعيل احمد سلطان البدراني
- المشرف
- خنساء محمد يونس الطائي
- الجامعة
- جامعة الموصل
- الكلية / القسم
- كلية العلوم / قسم علوم الحياة
- الشهادة
- ماجستير
- السنة
- 2022
- لغة الرسالة
- انكليزي
- الكلمات المفتاحية
- Acinetobacter baumannii ; Quorum Sensing ; Biofilm ; Auto Inducer Synthase
الملخص
تمثل الغرض من الدراسة الحالية عزل ، وتشخيصء وتقييم التباين في نسخ الجينات المرتبطة باستشعار النصاب ( abal gene ) ومقاومة المضادات الحيوية ( gene 0064 و عمعع (blaOXA-51 لعزلات Acinetobacter. baumannii السريرية المعزولة من مستشفيات الموصل (مستشفى السلام التعليمي ، مستشفى الموصل العام ، مستشفى الجمهوري التعليمي ، مستشفى ابن سينا التعليمي ، ومركز الحروق التخصصي ) . تم جمع 125 عينة من المرضى الراقدين في المستشفيات شملت مسحات الجروح )16( ، الادرار(13) ، سائل النخاع الشوكي (3 ) ، الدم (2) ، البلغم (11) ، مسحات الحلق (54) ،مسحات الحروق (26). شخصت العزلات مجهريا وكيميائيا باستخدام نظام 20 API ونظام WITEK-2 - من مجموع العينات تم تأكيد 25 عزلة فقط على أنها .A.baumannii كانت A.baumannii باعلى نسبة في مرضى الحروق )%40( وأقل نسبة في عينات المرضى من مسحات الحلق وعينات pall (908). استخدمت طريقة انتشار القرص ADA عشر نوعا من المضادات الحيوية في هذه الدراسة لتحديد حساسية المضادات الحيوية لجميع عزلات A-Dawmannii ، وقسمت النتائج الى ثلاث فئات (XDR) extensively drug-resistant , (MDR) multi-drug resistance (non-MDR ) non-multi-drug resistance , وبنسب 34.61 %, 53.84 %,11.53 #؟على التوالي. كانت نتائج إنتاج الأغشية الحيوية بنسب متفاوتة ، اذ وجدت أعلى نسبة لتكوين الاغشية الحيوية في مسحات الحروق )%24( ، وأقل نسبة وجدت في عينات الدم ومسحات الحلق ( 4 96). بينت جميع العزلات الفعالية الكمية والنوعية في انتاجها (AHL) CALEY acyl homoserine lactones باستخدام السلالة الكاشفة Agrobacterium. tumefaciens 5 . أظهرت نتائج GPCR وجود الجينات ad الدراسة في جميع العزلات المختارة ، وان كمية النسخ لجينات المقاومة للمضادات الحيوية (مضخات التدفق) جين 064 وجين 5/0014-1 منخفضًا في الطور اللوغارتمي ثم ارتفع في مرحلة طور الثبات. في حين أن جين المحفز الذاتي autoinducer Synthase gene ) 0501) عبر عنه بشكل كبير في الطور اللوغارتمي مقارنة بطور الثبات. |
Abstract
The purpose of this investigation was to isolate, identify, and evaluate the gene copy number variation of the genes associated with quorum sensing abaI gene and antibiotics resistance adeA gene , and blaOXA-51 gene of the clinical Acinetobacter. baumannii isolates isolated from Mosul hospitals (AL-salam teaching hospital, Mosul general hospital, AL-jumhurii teaching hospital, Ibin Sina teaching hospital, and Specialized burn center). Pathological samples were collected during period from the first of October to December in 2021.A total of 125 samples were collected from patients admitted different hospitals included wounds swab (16), urine (13), Cerebrospinal Fluid (3), blood (2), sputum (11), throat swab (54), burn swab (26). The isolates were identified by morphologicall and biochemically using the API 20 system, and VITEK-2 system. Only 25 isolates were confirmed as A.baumannii. The high percentage of A.baumannii appeared in burn patients (40%) and the lowest percentage was in patients with throat swabs and blood (8%). The disc diffusion method for thirteen types of antibiotics were used in this study to determine the antibiotic sensitivity for all A.baumannii isolates. Antibiotic susceptibility refers to the A. baumannii infection were divided into three categories multi-drug resistance (MDR), extensively drug-resistant (XDR), and non-multi-drug resistance ( non-MDR) , and the percentage 34.61%, 53.84%, and 11.53% respectively. The findings of biofilm production were varying proportions by using microtiter plate method, the highest percentage of biofilm formation was found in burn samples (24%), and the lowest percentage was found in blood samples and throat swabs (4%). All isolates showed quantitatively and qualitatively activity of acyl homoserine lactones (AHL) signals using the biosensor strain A. tumefaciens KYC55. The qPCR results demonstrated that the genes of interest were present in all selected isolates. The gene copy number variation of the antibiotic resistance genes (efflux pumps), adeA gene, and the blaOXA-51 gene were low in the log phase and then elevated in the stationary phase. While the autoinducer Synthase gene, abaI was highly expressed in log phase compared to the stationary phase.
طلب نسخة من الملف
الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.