الكشف عن المجتمع البكتيري بتقنية الميتاجينوم والتحري عن البكتريا المرضية Mycoplasma و Ureaplasma المعزولة من النساء في مدينة الموصل

الباحث

سارة بدري محمود علي الجماس

المشرف

أميرة محمود محمد الراوي

الجامعة

جامعة الموصل

الكلية / القسم

كلية العلوم / قسم علوم الحياة

الشهادة

ماجستير

السنة

2024

لغة الرسالة

عربي

الكلمات المفتاحية

الميتاجينوم ; المايكوبلازما ; اليوريابلازما ; المجتمع البكتيري

اولت الدراسة الحالية اهتماما بالتحري عن بكتيريا المايكودلازما Mycoplasma واليوريابلازما 64 حيث تم die 152 asi من المسحات المهبلية من قبل طبيبات النسائية الاختصاص باستخدام مسحات معقمة و المنظار من النساء في مدينة الموصل المراجعات لمستشفى الخنساء التعليمي ومستشفى البتول والعيادات الخارجية الأخرى. تم جمع العينات من النساء المصابات بالالتهابات المهبلية والعقم والمعرضات للاجهاض وال ولادة المبكرة و اللواتي يستخدمن اللولب aly ([UD)Intrauterine device يستخدمن المضادات الحيوية، والتي تبلغ اعمارهن ما بين 60-17 سنة ويشكل اكشر وضوحا شملت الدراسة تحديد البيئة الميكروبية باستخدام التحليل الميتاجينومي Mitogenomics Next-generation sequencing ( NGS ) وقد أظهررد ت نتائج التحليل تبايناً في عدد البكتيريا الموجودة في بيئة المهبل، حيث وجد أن هناك 23 نوعاً مختلفاً من البكتيرياء بعضها يعتبر بكتيريا طبيعية normal flora أو بكتيريا ممرضة:؛ بما في ذلك المايكويلازما واليوريابلازما. تم عزل بكتريا EPL GLI واليوريابلازما وتشخيصها باستخدام طرائق الزرع الروتينة على وسط PPLO) pleupneumo like organism ) والفحص المجهري باستخدام صبغه كمزا Giemsa stain والاختبارات الكيموحيوبة Cus تظهر اليوريابلازما نشاط اليوريز56356[] مما يميزها عن أنواع المايكويلازما في حين تمتاز المايكويلازما بقابليتها على تخمر سكر الكلوكوز اما اليوريابلازما ليس لها القدرة على تخمر HL Lull والعزلات البكتيرية للمايكوبلازما واليوريابلازما لم تظهر أي قدرة على انتاج انزيم الكتاليز catalase وانزيم الاوكسديز coxidase اما الكشف عن عوامل الضراوة فقد اظهرت جميع العزلات البكتيرية للمايكوبلازما واليوريابلازما غير منتجة لانزيم الهيمولايسين Lad امتلكتا المايكويلازما واليوريابلازما القدرة على انتاج انزيم البروتيز -Protease أظهرت النتائج ان المجموع الكلي للمسحات الموجبة 79 مسحة(652؟) المأخوذة من النساء المصابات بالالتهابات المهبلية والعقم والولادة المبكرة و الاجهاض والمستخدمات JUD بينما كانت المسحات السالبة 73 مسحة )%48( تباينت نسب المسحات بين الحالات التي تم اخذ المسحات منها حيث بلغت نسبة المسحات الماخوذة من النساء المصابات بالالتهابات المهبلية 47% بينما كانت نسبة المسحات للنساء المصابات بالعقم 40% فيما بلغت نسبة المسحات للنساء اللاتي حصل Gg) ولادة مبكرة 86 ويلغت اعلى نسبة للعينات الموجبه لحالات الإجهاض 70% بينما كانت نسبة النساء اللاتي يستخدمن وسيلة ails الحمل TUD 4396. تراوحت اعمار النساء اللواتي شملتهن الدراسة مابين 0ص لل C DF (60-17) سنة المعرضات لاصابات الجهاز التناسلي من التهابات مهبليه والاجهاض والولاده المبكرة والعقم ومستخدمي Gus PUD بلغت اعلى نسبة اصابة للمايكويلازما كانت للاعمار مابين (38-28) سنة بنسبة 8)22.2%( واليوريابلازما بنسبه 31)56%( في حين كانت اقل نسبة إصابة للمايكويلازما كانت للاعمار مابين )60-50( سنة بنسبة 2(11.196) واليوريابلازما بنسبه 6)33%( ونسبه الاعمار )27-17 ) بلغت المايكويلازما 3)5.45%( واليوريابلازما 5096 )18 (، ونسبة النساء(49-39) كانت نسبة المايكوبلازما 11.6% (5) واليوريابلازما56©4 (24). تضمنت الدراسة في الجانب الجزيئي استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) Polymerase chain reaction للتحري عن وجود المايكويلازما من خلال استهداف ope محدد من جين 16571074 ،rceA Gray والتحري عن جينات 1776056 للكشف عن اليوريابلازما وتم تسجيل عزلات محليه جديدة مقارنة مع العزلات العالمية المسجلة في موقع بنك الجينات العالمي (NCBI)National Center for Biotechnology Information دراسة لأول مرة. كما تناولت الدراسة في احد جوانبها التحري عن مقاومه كل من المايكويلازما واليوريابلازما لبعض المضادات الحيوية اذ ظهرت العزلات البكتيرية مقاومة شديدة للمضاد الحيوي Erythromycin ولم يظهر لها تأثيراً على العزلات المدروسة وبنسبة 100% بينما أبدت حساسية عالية تجاه المضاد الحيوي 112 وينسبة 100% للمايكويلازما وينسبة 50% لليوريا بلازما اما المضاد الحيوي culss Doxycycline المايكويلازما واليوربابلازما مقاومة اتجاه المضاد وبنسبة 50% والمضاد الحيوي 120010 فكانت نسبة المقاومه لهذه المضاد لعزلات المايكويلازما ELL gull بنسبة 50% والمضاد الحيوي 01710110:2012)بنسب متفاوتة LS أظهرت احدى العزلات المسجلة في موقع NCBI باسم SAMA3 متعددة المقاومة للمضادات لأول مرة.

A The current study paid attention to investigate Mycoplasma and Ureaplasma, as 152 samples of vaginal swabs were taken by specialized gynecologists using sterile swabs and speculum from women in Mosul city,who attending Al-Khansa Teaching Hospital, Al-Batoul Hospital, and other outpatient clinics. Samples were collected from women suffering from vaginal infections, infertility, and those at risk of miscarriage and preterm birth,and who used an intrauterine device (IUD) and did not use antibiotics. Their ages were between 60-17 years. More clearly, the study included determining the microbial environment using metagenomic analysis (Mitogenomics Next-generation Sequencing) (NGS) analysis results showed variation in the number of bacteria present in the vaginal environment, as it was found that there are 23 different types of bacteria, some of which are considered normal flora or pathogenic bacteria, including Mycoplasma and Ureaplasma. Mycoplasma and Ureaplasma were isolated and diagnosed using routine culture methods on PPLO (pleupneumo like organism) medium, microscopic examination using Giemsa stain, and biochemical tests, where ureaplasma shows urease activity, which distinguishes it from Mycoplasma species, while Mycoplasma is distinguished by its ability to ferment glucose, while Ureaplasma does not. It has the ability to ferment sugars, and the bacterial isolates of Mycoplasma and Ureaplasma did not show any ability to produce catalase or oxidase enzyme. As for the detection of virulence factors, all bacterial isolates of Mycoplasma and Ureaplasma showed that they did not produce hemolysin, while Mycoplasma and Ureaplasma had the ability to produce the protease enzyme. The results showed that the total number of positive swabs was 79 (52%) taken from women with vaginal infections, infertility, preterm birth, miscarriage, and IUD users, while the negative swabs were 73 (48%). The percentages of swabs varied between the cases from which the swabs were taken, as the percentage of swabs was taken from women with vaginal infections was 47%, those from women with infertility was 40%, the percentage of swabs from women who had preterm birth was 60%, and the highest percentage of positive samples for miscarriages was 70%, while the percentage of women who B used an IUD contraceptive method was 43%.The ages of the women included in the study ranged between (17-60) years, and they were exposed to infections of the gential system, such as vaginal infections, miscarriages, preterm birth, infertility, and IUD users. The highest rate of infection with Mycoplasma was for those aged between (28-38) years, was 22.2% (8) and Ureaplasma, at a rate of 56% (31), while the lowest percentage of infection with Mycoplasma was for ages between (50-60) years, at a rate of 11.1%(2), and for Ureaplasma, at a rate of 33%(6), and the percentage of ages (17-27) reached 5.45%(3), and for Ureaplasma, it was 18(50%),and the percentage of women was 39-49. The percentage of Mycoplasma was 5 (11.6%) and Ureaplasma was 24(56 (. % On the molecular side, the study included the use of polymerase chain reaction (PCR) to detect the presence of Mycoplasma by targeting a specific 16SrRNA gene and the rceA gene, and investigating the Urease genes to detect Ureaplasma. New local isolates were recorded and compared with global isolates registered on the Global GenBank website National Center for Biotechnology Information (NCBI). In another aspects, the study also investigated the resistance of both Mycoplasma and Ureaplasma to some antibiotics, as the bacterial isolates showed high resistance to Erythromycin, as it did not appear to have an effect on the studied isolates, at a rate of 100%, while Mycoplasma and Ureaplasma showed high sensitivity to Tetracycline, at a rate of 100% and 50% respectively, as for Doxycycline, Mycoplasma and Ureaplasma were resistant to 50%, while for Azithromycin and Chloramphenicol, the rate of resistance was 50% for Mycoplasma and Ureaplasma isolates, and Ciprofloxacin at varying rates, as one of the isolates registered on the NCBI website under the name SAMA3 showed multiple resistance to those antibiotics.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب